水樣過濾器通常使用的濾膜有微孔濾膜和超濾膜兩種。微孔濾膜的孔徑較小，通常于0.1微米以下，能夠有效的攔截水中的微小顆粒和大部分溶解物質；超濾膜的孔徑介于0.01-0.1微米之間，能夠進一步分離水中的膠體顆粒。膠體溶液和高分子有機物。