好的風扇，除了其風量大和風壓高之外，自身的可靠性是相當的重要，其中，風扇使用的軸承起著非常重要的作用。一般高速風扇使用滾珠軸承(ball bearing)，而低速風扇則使用成本較低廉的自潤軸承(sleeve bearing)。每個風扇都需要兩個軸承，一些風扇上標著"BS"的字樣，是單滾珠式軸承，BS的意思是"1 ball + 1 sleeve"，依然帶有自潤軸承的成分。比BS更高級的是雙滾珠式軸承，即Two Balls。下面將對各種軸承形式加以說明。
　　含油軸承(sleeve bearing)
　　含油軸承是使用滑動摩擦的套筒軸承，使用潤滑油作為潤滑劑和減阻劑，初期使用時運行噪音低，制造成本也低，但是這種軸承磨損嚴重，壽命較滾珠軸承有很大差距。而且這種軸承使用時間一長，由于油封的原因(電腦散熱器產品都不可能使用高檔油封，一般也就是普通的紙油封)，潤滑油會逐漸揮發，而且灰塵也會進入軸承，從而引起風扇轉速變慢，噪音增大等問題，嚴重的還會因為軸承磨損造成風扇偏心引發劇烈震動。出現這些現象，要么打開油封加油，要么就只有淘汰另購新風扇。 
　　滾珠軸承(ball bearing)
　　含油軸承由于使用周期較短，軸承內部的油控直接影響運轉時噪音大小，所以越來越被各知名大廠所摒棄。雙滾珠軸承現在被業界廣泛看好，成為高品質散熱器風扇的首選，運轉穩定性無出其右，但價格也較高。而作為物美價廉的選擇，各大廠商的折衷方案就是采用單滾珠軸承。
　　單滾珠軸承
　　單滾珠軸承是對傳統油封軸承的改進。它的轉子與定子之間用滾珠進行潤滑，并配以潤滑油。它克服了油封軸承壽命短，運行不穩定的毛病，而成本上升極為有限。單滾珠軸承吸收了油封軸承和雙滾珠軸承的優點。將軸承的使用壽命提升到了40,000小時，加入滾珠之后，運行噪聲有所增大，但仍小于雙滾珠軸承。
　　雙滾珠軸承
　　雙滾珠軸承屬于比較高檔的軸承。軸承中有數顆微小鋼珠圍繞軸心，當扇頁或軸心轉動時，鋼珠即跟著轉動。因為都是球體，所以摩擦力較小，且不存在漏油的問題。雙滾珠風扇優點是壽命較長，大約在50000 ~100000小時；抗老化性能好，適合轉速較高的風扇。雙滾珠軸承的缺點是制造成本高，并且在同樣的轉速水平下噪音最大(因為滾珠軸承摩擦點增加了2 倍)。雙滾珠風軸承和液壓軸承的封閉性較好，尤其是雙滾珠軸承。雙滾珠軸承被整個嵌在風扇中，轉動部分沒有與外界直接接觸。在密封的環境中，軸承的工作環境比較穩定。因此5000轉級別的大口徑風扇幾乎都使用雙滾珠軸承。而液壓軸承由于具備獨特的還回式油路，所以潤滑油泄露的可能性較小。
　　來福軸承
　　來福軸承(Rifle Bearing)技術的代表廠商是CoolerMaster，CM已經將旗下的大部分傳統油封軸承風扇升級到來福軸承。作為傳統油封軸承的改進，來福軸承采用耐磨材料制成高含油中空軸承，減小了軸承與軸芯之間摩擦力，來福軸承還帶有反向螺旋槽及擋油槽的軸芯，在風扇運轉時含油將形成反向回游，從而避免含油流失，因此提升了軸承壽命。來福軸承風扇通過采用以上結構及零件，使得含油及保油能力大幅提升，并降低了噪音。
　　HYPRO軸承
　　Hypro 軸承之名來源于HY(Hydrodynamic wave，流體力學波)PRO(Oil protection system，油護系統)，系知名散熱器及風扇設計制造廠家ADDA的專利產品，同是在傳統含油軸承基礎之上進行多項改進而成。Hypro與液壓軸承可謂殊途同歸，兩種設計各自采用了一些獨到的改進措施，但精髓同為循環油路系統，各方面的表現也基本相當。通常產品壽命可達50000小時以上。
　　液壓軸承 (Hydraumatic Bearing)
　　液壓軸承是在油封軸承的基礎上改進而來的。液壓軸承擁有比油封軸承更大的儲油空間，并有獨特的環回式供油回路。液壓軸承風扇的工作噪音又明顯的降低，使用壽命也非常長，可達到40000小時。但并非所有的AVC散熱器都采用液壓軸承風扇。由此可見，液壓軸承實質上仍然是一種油封軸承。但這種經過了改進，壽命比普通油封軸承大大延長了，并且繼承了油封軸承的優點——運行噪音小。
　　納米軸承 
傳統油封軸承風扇在使用過程中磨損比較嚴重，長時間使用時的可靠性較低。納米軸承有效的克服了這個問題：陶瓷軸承技術采用了納米級高分子材料與特殊添加劑充分融合，軸承核心全面采用納米級的氧化鋯粉，使用沖模及燒結工藝制成，晶體顆粒由過去的60um下降到了 0.3um，具有堅固、光滑、耐磨等特性。納米陶瓷軸承(NCB)具有很強的耐高溫能力，不易揮發，這大大延長了風扇的使用壽命，納米軸承的性質與陶瓷類似，越磨越光滑。據測試，采用納米陶瓷軸承(NCB)的風扇平均使用壽命都在15萬小時以上。